Google推AI新突破 可辨九成单一基因变异「良恶」
发布 : 2023-9-27 来源 : 明报新闻网 用微信扫描二维码，分享至好友和朋友圈 | 加关注  明声网温哥华 微信公众号 |
美国科网巨擘Google旗下人工智能（AI）部门DeepMind推出一套AI工具，评估约7100万个人类基因变异的性质，并能分辨出当中近九成是属于良性还是可致病，水平远高于目前的0.1%检测率。对展示利用AI协助加速判断由基因变异导致病症而言，今次研究可列首例，被视为人类对付基因病变的一大突破。
人类至今所知约有7100万个基因变异情况，这些变异改变了人体主要工作分子——蛋白质的结构，可能造成病变，但专家迄今只了解当中0.1%的临床影响。Google这套名为AlphaMissense的AI工具，以之前用于预测蛋白质结构的AI工具AlphaFold为蓝本而设计，它透过学习大量有关人类和其他灵长类动物致病或良性基因变异的数据，去预测变异造成的风险。
7100万种变异 原知0.1%影响
DeepMind周二（19日）在《科学》期刊发表有关研究报告，展示AlphaMissense在这方面的成果，显示工具在检视了7100万个出现单一「字母」改变的脱氧核糖核酸（DNA）后，发现有32%会导致病变，57%属良性，馀下不明，换言之它能够得知89%变异属良性或恶性，比目前科学家只能确定约0.1%变异性质大跃进。DeepMind伦敦总部项目研究员阿夫塞茨称昔日发现致病变异的实验昂贵又费力，但透过AI预测，研究人员「可一次过预览数以千计蛋白质的结果」，有助确定资源使用的优先次序。
另一项目研究员程俊说AlphaMissense有一定应用限制，包括它只能作出大概预测，而无法显示某一基因变异的生物物理本质。他强调临床诊断上AI预测仍须配合其他证据一起使用，但其预测有助提高罕见病的诊断率，也可能帮助到研究人员找到新的致病基因。
英国政府辖下英格兰基因组学有限公司（Genomics England）以旗下罕见病症基因变异资料库纪录跟AlphaMissense预测结果作比对，结果「令人赞叹」。副首席医疗官托马斯自言未有参与研发或提供训练用数据，可独立判断这套工具是「大跃进」。（金融时报/独立报）
人类至今所知约有7100万个基因变异情况，这些变异改变了人体主要工作分子——蛋白质的结构，可能造成病变，但专家迄今只了解当中0.1%的临床影响。Google这套名为AlphaMissense的AI工具，以之前用于预测蛋白质结构的AI工具AlphaFold为蓝本而设计，它透过学习大量有关人类和其他灵长类动物致病或良性基因变异的数据，去预测变异造成的风险。
7100万种变异 原知0.1%影响
DeepMind周二（19日）在《科学》期刊发表有关研究报告，展示AlphaMissense在这方面的成果，显示工具在检视了7100万个出现单一「字母」改变的脱氧核糖核酸（DNA）后，发现有32%会导致病变，57%属良性，馀下不明，换言之它能够得知89%变异属良性或恶性，比目前科学家只能确定约0.1%变异性质大跃进。DeepMind伦敦总部项目研究员阿夫塞茨称昔日发现致病变异的实验昂贵又费力，但透过AI预测，研究人员「可一次过预览数以千计蛋白质的结果」，有助确定资源使用的优先次序。
另一项目研究员程俊说AlphaMissense有一定应用限制，包括它只能作出大概预测，而无法显示某一基因变异的生物物理本质。他强调临床诊断上AI预测仍须配合其他证据一起使用，但其预测有助提高罕见病的诊断率，也可能帮助到研究人员找到新的致病基因。
英国政府辖下英格兰基因组学有限公司（Genomics England）以旗下罕见病症基因变异资料库纪录跟AlphaMissense预测结果作比对，结果「令人赞叹」。副首席医疗官托马斯自言未有参与研发或提供训练用数据，可独立判断这套工具是「大跃进」。（金融时报/独立报）